În urma adoptării Legii cu privire la reorganizarea instanțelor judecătorești, sistemul se confruntă o cu serie de probleme. Acestea au fost expuse de către membrii Consiliului Superior al Magistraturii (CSM), atunci când deputații din Comisia juridică, numiri și imunități au examinat statiul de implementare a reformei instanțelor. Astfel, membrii CSM au precizat că, în momentul în care prevederile legale au fost puse în aplicare, nu s-a ținut cont de analiza infrastructurii din raioane, starea drumurilor, accesibilitatea căilor de transport. La fel, o altă problemă este că nu s-a ținut cont de amplasarea penitenciarelor. Și asta pentru că deținuții urmează a fi transportați dintr-un raion în altul și apar dificultăți, întârzieri sau refuzuri de transport. Un impediment este că nu s-a ținut cont și de specificul populației în localități concrete. După reorganizarea instanțelor judecătorești, Curții de Apel Comrat, unde majoritatea populației este vorbitoare de limbă rusă și ședințele se desfășoară 80% în limba rusă, i-a fost atribuită Judecătoria Cimișlia (sediile Leova și Basarabeasca). În instanța din Cimișlia se vorbește limba română. Ar fi fost mai oportun ca instanța să fie atribuită Curții de Apel Cahul. În același timp, la implementarea legii nu s-a ținut cont de volumul de muncă al instanțelor. De exemplu, conform hărții judecătorești, Curții de Apel Chișinău i-a fost atribuită Judecătoria Orhei (sediul central, Telenești și Rezina). În opinia membrilor CSM, ar fi fost mai oportun să fie repartizată Curții de Apel Bălți, conform locului de amplasare, iar harta trebuie revizuită. În urma implementării Legii, din 44 de instanțe, au fost formate 15.